Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBP07199 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms