Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TBX6O95947 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBX6O95947 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBX6O95947 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms