Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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