Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
STX11O75558 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX11O75558 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX11O75558 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms