Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NPHP4O75161 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHP4O75161 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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