Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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