Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms