Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX2A2RU54 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms