Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms