Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMED7Q9Y3B3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms