Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms