Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms