Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms