Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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