Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms