Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms