Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms