Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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