Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms