Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms