Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms