Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRCQ99895 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms