Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms