Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAB3IPQ96QF0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms