Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms