Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

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Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZFP28Q8NHY6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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