Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SAMD13Q5VXD3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms