Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX2Q3B8N5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms