Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P3H1Q32P28 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms