Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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