Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms