Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA9Q13797 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA9Q13797 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA9Q13797 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA9Q13797 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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