Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms