Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms