Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms