Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF3P61204 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF3P61204 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms