Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5OP48047 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms