Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNPDA1P46926 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms