Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRATP43155 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRATP43155 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms