Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHP20382 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHP20382 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms