Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC166P0CW27 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms