Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms