Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSVO60911 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSVO60911 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms