Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD63C9JTQ0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms