Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms