Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PARP3Q9Y6F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP3Q9Y6F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP3Q9Y6F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms