Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX11Q9Y5W9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX11Q9Y5W9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms