Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO3Q9Y5L0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms