Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms