Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL3Q9Y4R7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms